特殊情况下土地出让续期估价期日和计算剩余年限确定的问题 

你说的这种情况比较特殊；如果当地政府或者国土局有出台文件规范该行为，按当地文件设定估价期日进行评估。
如果当地政府或国土资源局没有出台类似文件；
个人建议分两种情况：
①如果是各土地管理部门管理的原因造成延误办理的，应设定估价期日在原土地终止日，直接计算20年的土地价款。本案例中应设置在2013年。
②如果是个人原因造成的，建议分两步计算出让金
第一步计算：原土地终止日期至申请人申请之日（或批准延续之日）应补交土地价款，估价期日设定为原土地终止日期；本案例中即为2013年-2017年应补交地价款，估价期日设置在2013年
第二步计算：申请之日至新批准土地终止日期应补交地价，估价期日设定在申请之日（或批准延续之日）；本案例中应为2017-2033年，估价期日设定为2017年。
另外：如果当地国土部门的有详细的续期方案支持的话，直接计算2017-2033出让地价款,2013-2017年按划拨土地征收土地使用费，也是可行的